Los criterios empleados para seleccionar los 234 colegios e institutos en los que se implantará este programa han sido elegidos en función de su habitabilidad, tamaño (20 aulas en el caso de los IES y 12 en el de los CEIP) y situación geográfica, para llegar al mayor número de comarcas posible.
La viceconsejera de Educación y Deporte, y los directores generales de RRHH y de Atención a la Diversidad, Participación y Convivencia Escolar, Marta Escrivá, Juan Carlos Aunión y Daniel Bermúdez, han confirmado a los sindicatos que este programa experimental será evaluado, junto al PROA (Programa de Refuerzo, Orientación y Apoyo en los Centros Docentes Públicos de Andalucía), para que sirvan de base para el futuro Plan Plurianual de Refuerzo Educativo.
También han informado de que el Programa de Refuerzo se financia, en su mayor parte (10,5 millones de euros) con fondos europeos de carácter finalista y concreto, es decir, una partida que no se puede usar para otro fin y que se podrían perder si no se utilizan para este programa.